В структуру «Военного учебно-научного центра Военно-морского флота «Военно-морская академия имени Адмирала Флота Советского Союза
Н.Г. Кузнецова» входят:
- Военный институт (военно-морской)
- Военный институт (военно-морской политехнический)
- Центр подготовки иностранных военнослужащих;
- Военный институт (дополнительного профессионального образования)
- Научно-исследовательский институт (кораблестроения и вооружения ВМФ)
- Научно-исследовательский институт (оперативно-стратегических исследований)
- Научно-исследовательский институт (спасания и подводных технологий)
- Учебный центр в г. Сосновый бор
- Учебный центр в г. Обнинск
- Факультет (командно-штабной)
- Факультет (командно-инженерный)
- Научная рота